2012年，全院共获各类科研基金223项。获国家科技进步一等奖1项、二等奖1项，军队医疗成果一等奖1项，上海市科技进步奖一等奖1项、上海市医学科技一等奖1项，中华医学会科技一等奖1项、教育部科技进步一等奖1项等奖项。发表SCI论文427篇，总影响因子1235分，其中5分以上46篇，30分以上1篇。

    临床科研，打造研究型临床医生

    科研必须从临床中来，到临床中去才有出路。长海人认为，临床科研应以解决临床中的难题为突破口，以减轻患者痛苦、降低医疗费用作为努力方向和目标，这样才有生命力。

    2009年，心血管内科秦永文团队获得国家科技进步二等奖的项目“缺损性先天性心脏病介入治疗新技术方法及器械研制与临床应用”正是如此。

    立项之初，秦永文团队的目标是实现封堵材料国产化，以减轻患者负担，使介入治疗实现平民化，以促进推广和普及。他们设计了应用于膜周部室间隔缺损对称型封堵器，并于2001年12月在国际上率先应用于临床，使我国室间隔缺损介入治疗工作跃居世界前列。随后的应用中，他们发现不少患者在应用对称型双盘状封堵器后，会引起主动脉瓣反流而导致治疗失败，为此，他们又设计了零边偏心型室间隔缺损封堵器。室间隔缺损解剖较复杂，有25%左右为膜部瘤型或多孔型。针对此类室间隔缺损，秦永文团队继续研制了细腰型封堵器。这三种封堵器的问世使室间隔缺损的介入治疗适应症大大扩展，提高了室间隔缺损的介入治疗的成功率。也改变了以往基本上依赖进口器械的局面，使进口封堵器从市场占有率100%减少至不足10%，造福了广大先心病患者 ......